Механизмы бактериального иммунитета, обеспечивающие защиту от бактериофагов, — перспективный инструмент для биотехнологии, и их продолжают активно изучать. В Science вышло сразу две статьи о выявлении антифаговых систем в геномах бактерий с помощью машинного обучения. Одна посвящена разработке модели DefensePredictor, которая использует последовательность гена и четырех его «соседей» по геному в качестве контекста, чтобы предсказать, участвует ли этот белок в защите от фагов. Авторы другой статьи создали сразу три системы машинного обучения, каждая из которых предсказала кандидатные защитные белки. Эксперименты с заражением бактериальных клеток подтвердили антифаговую активность предсказанных белков. Обе группы ученых подчеркнули, что иммунитет бактерий гораздо разнообразнее, чем предполагалось.
Peter C. DeWeirdt et al., DefensePredictor: A machine learning model to discover prokaryotic immune systems. // Science 392, eadv7924 (2026). DOI: 10.1126/science.adv7924
Ernest Mordret et al., Protein and genomic language models uncover the unexplored diversity of bacterial immunity. // Science 392, eadv8275 (2026). DOI: 10.1126/science.adv8275
Подробнее в источнике
