Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Институт теоретической и экспериментальной биофизики
Российской академии наук
ИТЭБ (ru) en

Лаборатория ЯМР-исследований биосистем

И.о. Заведующего лабораторией
Тимченко Мария Александровна
(4967) 73-92-26

Краткая историческая справка

Метод ЯМР-спектроскопии в нашем институте появился в 1973 году в лаборатории радиоспектроскопии профессора Льва Петровича Каюшина. В 1983 г появилась группа ЯМР под руководством д.ф.-м.н., проф. Кутышенко В.П. при лаборатории Изотопных методов исследования (зав.лаб проф. Брусков В.И.). В 2003 году была образована отдельная лаборатория ЯМР-исследований биосистем, возглавляемая Кутышенко В.П. С ноября 2021 г заведующим лабораторией является кбн Тимченко Мария Александровна.

Основные направления исследований

В рамках лаборатории исследования ведутся по двум основным направлениям:
• Изучение структурно-динамических свойств белков, а также их взаимодействия с различными лигандами;
• Метаболомика - анализ метаболитного профиля биологических жидкостей и экстрактов из различных тканей животного и растительного происхождения для изучения особенностей метаболизма.
Лаборатория активно взаимодействует с другими лабораториями и институтами и участвует в совместных межлабораторных, межинститутских и международных проектах. 

Основные задачи, которые выполняет наша лаборатория в рамках сотрудничества:

• Определение и оценка состава метаболитов в биологических жидкостях (кровь, моча, слеза, спинномозговая жидкость, БАЛЖ, пот, слюна, амниотическая жидкость). 
• Определение и оценка состава метаболитов в экстрактах из тканей животных и растений. 
• Анализ бактериального метаболизма с определением состава метаболитов.
• Определение и подтверждение состава лекарственных препаратов, химических соединений и их смеси, анализ степени их чистоты.
• Мониторинг химических реакций, а также ферментативных реакций для низкомолекулярных субстратов, в режиме онлайн.
• Оценка качества, безопасности и аутентичности пищевой продукции.
• Оценка связывания белок-лиганд (в том числе, рецептор-лиганд)

Методы, используемые в работе

ЯМР-спектроскопия на разных ядрах, включая методы ЯМР-релаксации и спиновой диффузии, круговой дихроизм, сканирующая дифференциальная калориметрия, оптическая спектроскопия, флуоресцентная спектроскопия.

2023
  1. Azev, V.N., Baidakova, L.K., Chulin, A.N. et al. Regiospecific Preparation of a Suitably Protected β-Branched Aspartic Acid Dipeptide. Russ J Bioorg Chem 49, 775–784 (2023). https://doi.org/10.1134/S1068162023040052Bobylev
  2. A.G., Yakupova E.I., Bobyleva L.G., Molochkov N.V., Timchenko A.A., Timchenko M.A., Kihara H., Nikulin A.D., Gabdulkhakov A.G., Melnik T.N., Penkov N.V., Lobanov M.Y., Kazakov A.S., Kellermayer M., Mártonfalvi Z., Galzitskaya O.V., Vikhlyantsev I.M. Nonspecific Amyloid Aggregation of Chicken Smooth-Muscle Titin: In Vitro Investigations. Int J Mol Sci. 2023; 24(2):1056 10.3390/ijms24021056
  3. Krasnova OA, Minaychev VV, Akatov VS, Fadeev RS, Senotov AS, Kobyakova MI, Lomovskaya YV, Lomovskiy AI, Zvyagina AI, Krasnov KS, Shatalin YV, Penkov NV, Zhalimov VK, Molchanov MV, Palikova YA, Murashev AN, Maevsky EI, Fadeeva IS. Improving the Stability and Effectiveness of Immunotropic Squalene Nanoemulsion by Adding Turpentine Oil. Biomolecules. 2023 Jun 29;13(7):1053. doi: 10.3390/biom13071053. PMID: 37509089; PMCID: PMC10377128.
  4. Melnikov OI, Mustakhimov II, Reshetnikov AS, Molchanov MV, Machulin AV, Khmelenina VN, Rozova ON. Interchangeability of class I and II fumarases in an obligate methanotroph Methylotuvimicrobium alcaliphilum 20Z. PLoS One. 2023 Oct 26;18(10):e0289976. doi: 10.1371/journal.pone.0289976. PMID: 37883386; PMCID: PMC10602362
  5. Mikoulinskaia GV, Prokhorov DA, Chernyshov SV, Sitnikova DS, Arakelian AG, Uversky VN. Conservative Tryptophan Residue in the Vicinity of an Active Site of the M15 Family l,d-Peptidases: A Key Element in the Catalysis. Int J Mol Sci. 2023 Aug 26;24(17):13249. doi: 10.3390/ijms241713249. PMID: 37686055; PMCID: PMC10487532
  6. Molchanov V, Yegorov A, Molchanov M, Timchenko A, Novikov V, Novojilov N, Timchenko M. Novel Antimicrobial Peptide from the Hepatopancreas of the Red King Crab. Int J Mol Sci. 2023 Oct 26;24(21):15607. doi: 10.3390/ijms242115607. PMID: 37958589; PMCID: PMC10649287
  7. Prokhorov DA, Kutyshenko VP, Tarahovsky YS, Kukushkin NI, Khrenov MO, Kovtun AL, Zakharova NM. Solid Xenon Carrier Based on α-Cyclodextrin: Properties, Preparation, and Application. J Pharm Sci. 2023 Jan;112(1):344-349. doi: 10.1016/j.xphs.2022.08.014. Epub 2022 Aug 20. PMID: 35995207
  8. Varlamova E.G., Uspalenko N.I., Khmil N.V., Shigaeva M.I., Stepanov M.R., Ananyan M.A., Timchenko M.A., Molchanov M.V., Mironova G.D., Turovsky E.A. A Comparative Analysis of Neuroprotective Properties of Taxifolin and Its Water-Soluble Form in Ischemia of Cerebral Cortical Cells of the Mouse. Int J Mol Sci. 2023; 24(14):11436 10.3390/ijms241411436
  9. Анализ метаболитов в плазме крови мышей с перевитой гибридомой методом ЯМР-спектроскопии / С. Г. Молчанов, Н. М. Панкратова, А. Н. Панкратов [и др.] // Системная биология и биоинформатика (SBB-2023) : Тезисы докладов 14-ой международной школы молодых ученых, Новосибирск, 22–26 мая 2023 года. – Новосибирск: Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, 2023. – С. 22.
  10. Новые психроактивные бактерии криопэгов полуострова Ямал / Я. В. Рыжманова, В. Э. Трубицин, Е. М. Ривкина [и др.] // Криосфера Земли. – 2023. – Т. 27, № 6. – С. 51-58.
  11. Особенности олигомеризации гладкомышечного титина и скелетного миозин-связывающего белка с / Л. Г. Бобылева, М. А. Тимченко, Э. И. Якупова [и др.] // Биофизика. – 2023. – Т. 68, № 3. – С. 461-465. – DOI 10.31857/S0006302923030055. – EDN FQJHUE.
  12. Удобный метод получения трет-бутиловых эфиров Nα-защищенных аминокислот из трет-бутанола / В. Н. Азев, А. Н. Чулин, М. В. Молчанов, А. И. Мирошников // Биоорганическая химия. – 2023. – Т. 49, № 3. – С. 291-295. – DOI 10.31857/S0132342323030053. – EDN PDKPOP
  13. Тимченко М.А. Аракелян А.Г., Микулинская Г.В., Прохоров Д.А. СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ЭНДОЛИЗИНА БАКТЕРИОФАГА RB49 //В книге: Теоретическая и экспериментальная биофизика. Материалы конференции. 2023. С. 14.
  14. Тимченко М.А. Аракелян А.Г., Микулинская Г.В., Прохоров Д.А., Чернышов С.В. КОНСЕРВАТИВНЫЙ ОСТАТОК ТРИПТОФАНА КАК ВАЖНЫЙ ЭЛЕМЕНТ КАТАЛИТИЧЕСКИ АКТИВНЫХ ФОРМ ЭНДОЛИЗИНОВ БАКТЕРИОФАГОВ RB49 И T5 //В книге: III Школа-конференция молодых ученых, аспирантов и студентов "Генетические технологии в микробиологии и микробное разнообразие". Сборник тезисов (в рамках IX Пущинской конференции "Биохимия, физиология и биосферная роль микроорганизмов"). Москва, 2023. С. 13-15.
  15. Тимченко М.А. Бобылёва Л.Г., Урюпина Т.А., Молочков Н.В., Тимченко А.А., Тимченко М.А., Пеньков Н.В., Галзитская О.В., Вихлянцев И.М., Бобылёв А.Г. ИССЛЕДОВАНИЕ АМИЛОИДНОЙ АГРЕГАЦИИ МУЛЬТИДОМЕННОГО ГИГАНТСКОГО БЕЛКА ТИТИНА //В книге: Теоретическая и экспериментальная биофизика. Материалы конференции. 2023. С. 18-21.
  16. Тимченко М.А. Быков А.С., Егоров А.Е., Панкратова Н.М., Панкратов А.Н., Молчанов М.В., Чернов А.С., Тимченко М.А. СРАВНЕНИЕ ПОДХОДОВ ОЦЕНКИ ИЗМЕНЕНИЯ МЕТАБОЛИТОВ ДЛЯ РАННЕЙ ДИАГНОСТИКИ РАЗВИТИЯ ГИБРИДОМЫ //В книге: Open Science 2023. сборник тезисов X Всероссийского молодежного научного форума с международным участием. Гатчина, 2023. С. 90.
  17. Тимченко М.А. Воропаев Г.С., Тимченко Н.А., Егоров А.Е. ВОЗМОЖНОСТИ ЯМР-СПЕКТРОСКОПИИ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ ЗАБОЛЕВАНИЙ ОРГАНОВ ДЫХАНИЯ НА МОДЕЛИ БЛЕОМИЦИН-ИНДУЦИРОВАННОГО ФИБРОЗА ЛЕГКИХ У МЫШЕЙ //В книге: X МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ. Сборник тезисов. Новосибирск, 2023. С. 311-312.
  18. Тимченко М.А. Микулинская Г.В., Чернышов С.В., Мусаева А.А., Тарлачков С.В., Азев В.Н., Прохоров Д.А. L,D-ПЕПТИДАЗА БАКТЕРИОФАГА 3 AEROMONAS И КАЛЬЦИЕВАЯ РЕГУЛЯЦИЯ ФАГОЛИЗИСА //В сборнике: Рецепторы и внутриклеточная сигнализация. сборник статей. Пущино, 2023. С. 148-153.
  19. Тимченко М.А. Молчанов С.Г., Панкратова Н.М., Панкратов А.Н., Молчанов М.В., Чернов А.С., Тимченко М.А. АНАЛИЗ МЕТАБОЛИТОВ В ПЛАЗМЕ КРОВИ МЫШЕЙ С ПЕРЕВИТОЙ ГИБРИДОМОЙ МЕТОДОМ ЯМР-СПЕКТРОСКОПИИ //В книге: Системная биология и биоинформатика (SBB-2023). Тезисы докладов 14-ой международной школы молодых ученых. Новосибирск, 2023. С. 22.
  20. Тимченко М.А. Мусаева А.А., Чернышов С.В., Молочков Н.В., Прохоров Д.А., Микулинская Г.В. НОВАЯ КАЛЬЦИЙ-ЗАВИСИМАЯ ПЕПТИДОГЛИКАНГИДРОЛАЗА БАКТЕРИОФАГА 3 AEROMONAS SP //В книге: XXXV ЗИМНЯЯ МОЛОДЁЖНАЯ НАУЧНАЯ ШКОЛА "ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ФИЗИКО- ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ. Сборник тезисов. Москва, 2023. С. 26.
  21. Тимченко М.А. Мусаева А.А., Чернышов С.В., Прохоров Д.А., Микулинская Г.В. СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ЭНДОЛИЗИНА ФАГА 3 AEROMONAS //В книге: Сборник тезисов 26-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием "БИОЛОГИЯ - НАУКА XXI ВЕКА". Пущино, 2023. С. 171.
  22. Тимченко М.А. Николаева Т.И., Лауринавичюс К.С., Молчанов М.В., Кузнецова С.М., Емельяненко В.И., Шеховцов П.В. КОМПЛЕКС НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНЫХ ПЕПТИДОВ КОЛЛАГЕНА И ГЛИКОЗАМИНОГЛИКАНОВ ДЛЯ ПРОФИЛАКТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ БОЛЕЗНЕЙ ОПОРНО-ДВИГАТЕЛЬНОГО АППАРАТА //В сборнике: VII Съезд биофизиков России. Сборник научных трудов. В 2-х томах. Краснодар, 2023. С. 210-211.
  23. Тимченко М.А. Николаева Т.И., Молчанов М.В., Шеховцов П.В., Лауринавичюс К.С. БИОКАТАЛИТИЧЕСКИЙ ПОДХОД К ПОЛУЧЕНИЮ КОМПЛЕКСОВ КОРОТКИХ ПЕПТИДОВ КОЛЛАГЕНА И ДИСАХАРИДОВ ГЛИКОЗАМИНОГЛИКАНОВ ДЛЯ ПРОФИЛАКТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ БОЛЕЗНЕЙ СУСТАВОВ //В книге: Дни ревматологии в Санкт-Петербурге - 2023. Всероссийский конгресс с международным участием. Сборник тезисов. Санкт-Петербург, 2023. С. 117-118.
  24. Тимченко М.А. Поздняков Н.В., Молчанов М.В., Пономарёва Т.И., Рыков В.А., Лукин А.М., Шилов С.В., Согорин Е.А. ВЛИЯНИЕ ГИДРОЛИЗАТА ИЗОЛЯТА БЕЛКА СОИ НА АДАПТАЦИЮ К ФИЗИЧЕСКОЙ НАГРУЗКЕ У КРЫС //В книге: Теоретическая и экспериментальная биофизика. Материалы конференции. 2023. С. 82-83.
  25. Тимченко М.А. Урюпина Т.А., Бобылёва Л.Г., Тимченко М.А., Вихлянцев И.М., Бобылёв А.Г. ИССЛЕДОВАНИЕ МОРФОЛОГИИ КОМПЛЕКСОВ ТИТИНА И МИОЗИН- СВЯЗЫВАЮЩЕГО БЕЛКА С МЕТОДОМ АТОМНО-СИЛОВОЙ МИКРОСКОПИИ //В книге: Сборник тезисов 26-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием "БИОЛОГИЯ - НАУКА XXI ВЕКА". Пущино, 2023. С. 262-263.
  26. Тимченко М.А. Урюпина Т.А., Бобылёва Л.Г., Тимченко М.А., Некрасов П.В., Вихлянцев И.М., Бобылёв А.Г. СТРУКТУРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ АМИЛОИДНЫХ АГРЕГАТОВ ТИТИНА СКЕЛЕТНЫХ МЫШЦ КРОЛИКА //В книге: XXXV ЗИМНЯЯ МОЛОДЁЖНАЯ НАУЧНАЯ ШКОЛА "ПЕРСПЕКТИВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ФИЗИКО- ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И БИОТЕХНОЛОГИИ. Сборник тезисов. Москва, 2023. С. 37.
2022
  1. Timchenko M, Molchanov V, Molchanov M, Timchenko A, Sogorin E. Investigation of lipolytic activity of the red king crab hepatopancreas homogenate by NMR spectroscopy. PeerJ. 2022;10:e12742. Published 2022 Jan 3. doi:10.7717/peerj.12742.
  2. Сорокина С.С., Паскевич С.И., Заичкина С.И., Мальков А.Е., Пикалов В.А. Сочетанное действие защитных агентов и ускоренных ионов углерода на поведение мышей. Радиационная биология. Радиационная экология, 2022, том 62, № 1, с. 49–54. doi: 10.31857/S0869803121060102
2021
  1. Паскевич С.И., Кутышенко В.П., Прохоров Д.А., Микулинская Г.В., Молочков Н.В., Егоров А.Е., Уверский В.Н. СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ АКТИВНЫХ ЦЕНТРОВ ОРТОЛОГИЧНЫХ ЭНДОЛИЗИНОВ БАКТЕРИОФАГОВ ESCHERICHIA COLI ENDOT5, ENDORB43 И ENDORB49//В книге: Теоретическая и экспериментальная биофизика. Материалы конференции «Теоретическая и экспериментальная биофизика». Под ред. чл.-корр. РАН Иваницкого Г.Р., 2021. С. 54-55.
  2. Kutyshenko, Victor P.; Prokhorov, Dmitry A.; Mikoulinskaia, Galina, V; Molochkov, Nikolai, V; Yegorov, Alexander Y.; Paskevich, Svetlana, I; Uversky, Vladimir N., Comparative analysis of the active sites of orthologous endolysins of the Escherichia lytic bacteriophages T5, RB43, and RB49//INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES, 2021, Volume: 166, pp: 1096-1105, 10.1016/j.ijbiomac.2020.10.264
  3. Yegorov, A. Y.; Potekhin, S. A., Heat denaturation of ribonuclease under high pressure: Differential scanning microcalorimetry study//THERMOCHIMICA ACTA, 2021, Volume: 698, Article Number: 178885, 10.1016/j.tca.2021.178885
  4. Архипова О.В., Таухутдинова С.Р., Ашин В.В., Захарова М.В., Микулинская Г.В., Молочков Н.В., Кутышенко В.П., Прохоров Д.А. ХАРАКТЕРИСТИКА РЕКОМБИНАНТНОЙ МЕТАКРИЛАТРЕДУКТАЗЫ RMRD GEOBACTER SULFURREDUCENS AM-1//В книге: VII Пущинская конференция "Биохимия, физиология и биосферная роль микроорганизмов". Школа-конференция для молодых ученых, аспирантов и студентов "Генетические технологии в микробиологии и микробное разнообразие". Сборник тезисов конференции. Под редакцией Т.А. Решетиловой. Москва, 2021. С. 123-124.
  5. Rozova, Olga N.; Ekimova, Galina A.; Molochkov, Nikolai V.; Reshetnikov, Alexander S.; Khmelenina, Valentina N.; Mustakhimov, Ildar I., Enzymes of an alternative pathway of glucose metabolism in obligate methanotrophs//SCIENTIFIC REPORTS, 2021, Volume: 11, Issue: 1, Article Number: 8795, 10.1038/s41598-021-88202-x
  6. Bobyleva, Liya G.; Shumeyko, Sergey A.; Yakupova, Elmira I.; Surin, Alexey K.; Galzitskaya, Oxana V.; Kihara, Hiroshi; Timchenko, Alexander A.; Timchenko, Maria A.; Penkov, Nikita V.; Nikulin, Alexey D.; Suvorina, Mariya Yu.; Molochkov, Nikolay V.; Lobanov, Mikhail Yu.; Fadeev, Roman S.; Vikhlyantsev, Ivan M.; Bobylev, Alexander G., Myosin Binding Protein-C Forms Amyloid-Like Aggregates In Vitro//INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2021, Volume: 22, Issue: 2, Article Number: 731, 10.3390/ijms22020731
  7. Sliadovskii, Dmitrii; Ponomareva, Tatyana; Molchanov, Maxim; Pozdnyakova-Filatova, Irina; Timchenko, Maria; Marchenkov, Victor; Gusev, Oleg; Sogorin, Evgeny, beta-elimination of hyaluronate by red king crab hyaluronidase//SCIENTIFIC REPORTS, 2021, Volume: 11, Issue: 1, Article Number: 22600, 10.1038/s41598-021-01890-3
  8. Azev, Viatcheslav; Chulin, Alexey; Molchanov, Maxim; Prokhorov, Dmitry; Mikoulinskaia, Galina; Uversky, Vladimir N.; Kutyshenko, Viktor, Chemical synthesis of peptidoglycan mimetic-disaccharide-tetrapeptide conjugate and its hydrolysis by bacteriophage T5, RB43 and RB49 L-alanyl-D-glutamate peptidases//PEERJ, 2021, Volume: 9, Article Number: e11480, 10.7717/peerj.11480
  9. Сатина Л.Я., Хатыпов Р.А., Коппель Л.А., Кутышенко В.П., Тимченко М.А., Проскуряков И.И., Кенина И.Б. //СПЕКТРАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ БИОЛОГИЧЕСКИХ МАКРОМОЛЕКУЛ (МОДУЛЬ 3)
 2020
  1. Kutyshenko V.P., Mikoulinskaia G.V., Prokhorov D.A., Molochkov N.V., Yegorov A.Y., Uversky V.N. On the roles of calcium and zinc ions in the formation of a catalytically active form of the metalloenzyme, L-alanyl-D-glutamate peptidase of the bacteriophage T5 (EndoT5), 2020, INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES, Том: 164, c.: 2711-2716
  2. Kutyshenko V.P., Sharapov M.G., Uversky V.N. Can a retro-polypeptide fold into a globule?, 2020, JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE AND DYNAMICS, Том: 38, Выпуск : 9, c.: 2763-2767
  3. Ponomareva T., Sliadovskii D., Timchenko M., Molchanov M., Timchenko A., Sogorin E. The effect of hepatopancreas homogenate of the Red king crab on HA-based filler, 2020, PEERJ, Том: 2020, Выпуск : 2, Статья №:  e8579, 
  4. Vorobyev S.I., Kutyshenko V.P., Bolevich S.B., Votrin S.V., Orlova A.S., Bolevich S., Morozova E.M., Kartashova M.K. Gas transport characteristics of hemocorrectors and perfusates based on perfluorocarbon blood-substituting emulsions [Gasno transportne karakteristike hemokorektora i perfuzata zasnovanih na perfluorokarbonskim emulzijama koje se dodaju u krv], 2020, SERBIAN JOURNAL OF EXPERIMENTAL AND CLINICAL RESEARCH, Том: 21, Выпуск : 2, c.: 147-155
  5. Пономарева Т.И., Слядовский Д.А., Тимченко М.А., Молчанов М.А., Тимченко А.А., Лапаев С., Поздняков Н.В., Бочарова К.А., Филиппов М.В., Согорин Е.А.  IN VITRO ИЗУЧЕНИЕ ДЕЙСТВИЯ ГИАЛУРОНИДАЗ ГЕПАТОПАНКРЕАСА КАМЧАТСКОГО КРАБА НА ФИЛЛЕРЫ ГИАЛУРОНОВОЙ КИСЛОТЫ В книге: СБОРНИК ТЕЗИСОВ 24-ой Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых «БИОЛОГИЯ - НАУКА XXI ВЕКА»  с. 121
2019
  1. "A PHARMACOLOGICAL COMPOSITION FOR INDUCTION OF A REVERSIBLE TORPOR-LIKE STATE AND HYPOTHERMIA IN RATS Zakharova, NM; Tarahovsky, YS; Fadeeva, IS; Komelina, NP; Khrenov, MO; Glushkova, OV; Prokhorov, DA; Kutyshenko, VP; Kovtun, AL//LIFE SCIENCES Том: 219,  Выпуск: , Стр: 190-198, Опубликовано: FEB 15 2019"
  2. "CAN A RETRO-POLYPEPTIDE FOLD INTO A GLOBULE? Kutyshenko, VP; Sharapov, MG; Uversky, VN//JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS Том: ,  Выпуск: , Стр: -, Опубликовано:  "
  3. "EFFECT OF C-TERMINAL HIS-TAG AND PURIFICATION ROUTINE ON THE ACTIVITY AND STRUCTURE OF THE METALLOENZYME, L-ALANYL-D-GLUTAMATE PEPTIDASE OF THE BACTERIOPHAGE T5 Kutyshenko, VP; Mikoulinskaia, GV; Chernyshov, SV; Yegorov, AY; Prokhorov, DA; Uversky, VN//INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES Том: 124,  Выпуск: , Стр: 810-818, Опубликовано: MAR 1 2019"
  4. "EFFECT OF SINGLE AMINO ACID SUBSTITUTIONS BY ASN AND GLN ON AGGREGATION PROPERTIES OF BENCE-JONES PROTEIN BIF Timchenko, M; Abdullatypov, A; Kihara, H; Timchenko, A//INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES Том: 20,  Выпуск: 20, 5197, Опубликовано: OCT 2 2019"
  5. "HYDROXYCOBALAMIN CATALYZES THE OXIDATION OF DIETHYLDITHIOCARBAMATE AND INCREASES ITS CYTOTOXICITY INDEPENDENTLY OF COPPER IONS Solovieva, ME; Shatalin, YV; Solovyev, VV; Sazonov, AV; Kutyshenko, VP; Akatov, VS//REDOX BIOLOGY Том: 20,  Выпуск: , Стр: 28-37, Опубликовано: JAN 2019"
  6. "INVESTIGATION OF THE CALCIUM-INDUCED ACTIVATION OF THE BACTERIOPHAGE T5 PEPTIDOGLYCAN HYDROLASE PROMOTING HOST CELL LYSIS Kovalenko, AO; Chernyshov, SV; Kutyshenko, VP; Molochkov, NV; Prokhorov, DA; Odinokova, IV; Mikoulinskaia, GV//METALLOMICS Том: 11,  Выпуск: 4, Стр: 799-809, Опубликовано: APR 1 2019"
2018
  1. Mikoulinskaia GV, Chernyshov SV, Shavrina MS, Molochkov NV, Lysanskaya VY, Zimin AA. Two novel thermally resistant endolysins encoded by pseudo T-even bacteriophages RB43 and RB49. J Gen Virol. 2018 Feb 1. doi: 10.1099/jgv.0.001014.
  2. Solovieva M.E., Shatalina Yu.V., Solovyev V.V., Sazonov A.V., Kutyshenko V.P., Akatov V.S. Hydroxycobalamin catalyzes the oxidation of diethyldithiocarbamate and increases its cytotoxicity independently of copper ions. Redox Biology 20 (2019) 28–37.
  3. Буданцев А.Ю., Кутышенко В.П. Окиcлительно-воccтановительные pеакции в xpомcодеpжащиx фикcатоpаx биологичеcкого матеpиала. Биофизика, 2018, том 63, вып. 5, c. 837–843.
  4. Егоров А.Е., Потехин С.А. Стабилизация лизоцима при высоком давлении. Дифференциальная сканирующая микрокалориметрия. Молекулярная биология, 2018, том 52, №1, с. 36–42.
  5. Николаева Т.И., Лауринавичус К.С., Капцов В.В., Молчанов М.В., Шеховцов П.В. Разработка комплекса низкомолекулярных пептидов коллагена с гликозаминогликановыми компонентами. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2018, том 165, №5, с. 571-576.
  6. Тимченко М.А., Тимченко А.А. Влияние точечной мутации в константном домене белка бенсджонса BIF на его агрегационные свойства. Биохимия, 2018, том 83, вып. 2, с. 166 – 179.
2017
  1. Kutyshenko VP, Prokhorov DA, Mikoulinskaia GV, Molochkov NV, Paskevich SI, Uversky VN. Evidence of the residual tertiary structure in the urea-unfolded form of the bacteriophage T5 endolysin. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. (2017) 35(6), pp. 1331-1338. doi: 10.1080/07391102.2016.1182948. 
  2. Popova I, Malkov A, Ivanov AI, Samokhina E, Buldakova S, Gubkina O, Osypov A, Muhammadiev RS, Zilberter T, Molchanov M, Paskevich S, Zilberter M, Zilberter Y. Metabolic correction by pyruvate halts acquired epilepsy in multiple rodent models. Neurobiol Dis. 2017 Oct;106, pp. 244-254. doi: 10.1016/j.nbd.2017.07.012.Epub 2017 Jul 12.
  3. Samokhina E, Popova I, Malkov A, Ivanov AI, Papadia D, Osypov A, Molchanov M, Paskevich S, Fisahn A, Zilberter M, Zilberter Y. Chronic inhibition of brain glycolysis initiates epileptogenesis. J Neurosci Res. 2017 Nov;95(11):2195-2206. doi: 10.1002/jnr.24019. Epub 2017 Feb 2.
  4. Timchenko A., Timchenko M., Matsumura Y., Kihara H. SAXS study of Bence-Jones protein BIF at different ionic conditions. Photon Factory Activity Report 2016 #34 (2017), p.300, http://pfwww.kek.jp/acr/2016pdf/u_reports/pf16b0300.pdf
  5. Timchenko A., Timchenko M., Matsumura Y., Kihara H. SAXS study of Y187N mutant of Bence-Jones protein BIF. Photon Factory Activity Report 2016 #34 (2017), p.303, http://pfwww.kek.jp/acr/2016pdf/u_reports/pf16b0303.pdf
  6. Timchenko M. A., Timchenko A. A. Influence of a Single Point Mutation in the Constant Domain of the Bence-Jones Protein BIF on Its Aggregation Properties. Biochemistry (Moscow), Papers in Press, (2017) BM17-201, doi: 10.1134/S0006297918020037
  7. Tischenko V.M., Zav’yalov V.P., Ryazantsev S.N. Human myeloma IgG4 reveals relativly rigid asymmetric Y-like structure with different conformational stability of CH2 domains. Molecular Immunology (2017) 92, pp. 199–210. https://doi.org/10.1016/j.molimm.2017.10.014.
  8. Yakupova E.I., Vikhlyantsev I.M., Bobyleva L.G., Penkov N.V., Timchenko A.A., Timchenko M.A., Enin G.A., Khutzian S.S., Selivanova O.M., Bobylev A.G. Different amyloid aggregation of smooth muscles titin in vitro. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. (2017) 10, pp. 1-12. doi: 10.1080/07391102.2017.1348988
2016
  1. Bobylev AG, Galzitskaya OV, Fadeev RS, Bobyleva LG, Yurshenas DA, Molochkov NV, Dovidchenko NV, Selivanova OM, Penkov NV, Podlubnaya ZA, Vikhlyantsev IM. Smooth muscle titin forms in vitro amyloid aggregates. Biosci Rep. 2016 May 20;36(3). pii: e00334. doi: 10.1042/BSR20160066. PMID: 27129292
  2. Kutyshenko V. P., Mikoulinskaia G. V., Molochkov N. V., Prokhorov D. A., Taran S. A., Uversky V. N. Structure and dynamics of the retro-form of the bacteriophage T5 endolysin. Biochimica et Biophysica Acta 1864 (2016) 1281–1291
  3. Kutyshenko V. P., Prokhorov D. A., Mikoulinskaia G. V., Molochkov N. V., Paskevich S. I., Uversky V. N.. Evidence for the residual tertiary structure in the urea-unfolded form of bacteriophage T5 endolysin. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2016 http://dx.doi.org/10.1080/07391102.2016.1182948
  4. Shavrina MS, Zimin AA, Molochkov NV, Chernyshov SV, Machulin AV, Mikoulinskaia GV. In vitro study of the antibacterial effect of the bacteriophage T5 thermostable endolysin on Escherichia coli cells. J Appl Microbiol. 2016 Nov;121(5):1282-1290. doi: 10.1111/jam.13251. PMID: 27501055
  5. Николаева Т.И., Молчанов М.В., Лауринавичюс К.С., Капцов В.В., Шевцов П.В. Исследование ферментативного гидролиза коллагенов хрящевой ткани. Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований № 10, 2016, с. 442 – 447.
2015
  1. Kubareva E.A., Yang F., Ryazanova A.Yu., Dolinnaya N. G., Golovin A.V., Molochkov N.V., Romanova E.A., Karpova E.A., Zatsepin T.S., Oretskaya T.S. Thymidine Glycol: The Effect on DNA Structure and DNA Binding by Site-Specific Proteins. Natural Science, 2015, Vol.7 No.11, pp 491-509.
  2. Kutyshenko V. P., Budantsev A.Yu., and Uversky V. N. Analysis of seasonal changes in plants by high-resolution NMR spectroscopy: Looking at the aqueous extracts from different plant tissues. Journal of Nature and Science, 2015. Vol.1, No.5, e88, 201
  3. Kutyshenko V.P., Beskaravayny P.M., Uversky V.N. “In-plant” NMR: Analysis of the Intact Plant Vesicularia dubyana by High Resolution NMR Spectroscopy. Molecules 2015, 20, 4359-4368; doi:10.3390/molecules20034359.
  4. Prokhorov D.A., Mikoulinskaia G.V., Molochkov N.V., Uversky V.N., Kutyshenko V.P. High-resolution NMR structure of a Zn2+- containing form of the bacteriophage T5 L-alanyl-D-glutamate peptidase. RSC Adv., 2015, 5, 41041- 41049.
  5. Тищенко В.М. Миеломный иммуноглобулин человека четвертого подкласса (IgG4 МАМ) содержитфракцию с асимметричнымисвойствами CH2 доменов. Биохимия, 2015, том 80, вып. 1, с. 29 – 40.
2014
  1. Basova L.V., Tiktopulo E.I., Kutyshenko V.P., Klenin S.I., Balobanov V. A., Bychkova V.E.Membrane‑induced changes in the holomyoglobin tertiary structure: interplay with function. Eur Biophys J., 2014, v.4, pp. 317–329
  2. Xpамов P.Н., Фаxpануpова Л.И., Паскевич С.И., Анисимов С.И., Маноxин А.А., Симонова Н.Б, Давыдова Г.А., Селезнева И.И. Исследование воздействия солнечного света, преобразованного люминофорсодержащими материалами, на функциональное состояние клеток в условиях in vitro и in vivo. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2014, т. 158, №10,436-440 сс.
  3. Бескаравайный П.М., Молчанов М.В., Сусликов А.В., Паскевич С.И., Кутышенко В.П., Воробьев С.И. ЯМР- исследование биологических жидкостей человека для выявления патологий. Биохимия, 2014, т. 8, № 2, 143-149 сс.
  4. Тищенко В.М. Корреляция между макро - и микро - стабильностью СН2 доменов IgG2 человека и их биологической активностью. I. Анализ калориметрических и оптических кривых плавления. Молекулярная биология, 2014, 48, 480-490 сс.
  5. Тищенко В.М. Корреляция между макро - и микро - стабильностью СН2 доменов IgG2 человека и их биологической активностью. II. Расчёт термодинамических функций, характеризующих стабильность доменов. Молекулярная биология, 2014, 48, 842-849 сс
Возврат к списку
Российский научный фонд
Российский фонд фундаментальных исследований
Совет по грантам президента Российской федерации
Российская академия наук
Наука и университеты
Министерство науки и высшего образования Российской федерации
Администрация Пущино
Правительство Московской области
ЦБП БЕН РАН

В случае обнаружения ошибок или по вопросам размещения информации Вы можете связаться с администратором сайта.
site@iteb.pushchino.ru